基于受體庫的虛擬藥物篩選:超大規模分子對接軟件研制

藥物性能不僅取決于藥效，而是依賴于藥效和毒副作用等指標的平衡。目前，評估化合物與特定受體結合能力的研究手段比較完善，但是充分評估藥物分子與各種蛋白質的結合能力還面臨很大的困難。在毒副作用研究方面尚未具備理性設計能力，只能通過昂貴的動物實驗進行評估。在投資巨大的臨床研究階段，大批候選藥物因為毒副作用而退出臨床，帶來巨額損失。評估藥物與數千個受體的結合能力，目前無法通過實驗研究實現。分子對接(DOCK) 是研究小分子與蛋白質相互作用的常用工具之一，被廣泛用于快速評估小分子與受體的結合能力。

本項目設計了兼容UCSF  DOCK3格式輸入的自研分子對接軟件SWDOCK。支持神威?太湖之光和新一代神威超級計算機。在測試中可以達到平均每個受體在單核組上0.0075s的對接速度。并且具有良好的并行擴展性。